Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vsx2Q61412 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms