Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Foxd1Q61345 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxd1Q61345 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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