Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Klf3Q60980 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms