Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Neurod1Q60867 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Neurod1Q60867 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms