Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prdm1Q60636 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prdm1Q60636 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms