Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp13a3Q5XF89 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms