Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cxcl17Q5UW37 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cxcl17Q5UW37 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cxcl17Q5UW37 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cxcl17Q5UW37 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcl17Q5UW37 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms