Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms