Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam71bQ5STT6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms