Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sft2d1Q5SSN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sft2d1Q5SSN7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms