Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88aQ5SNZ0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms