Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Trappc1Q5NCF2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc1Q5NCF2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms