Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim58Q5NCC9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Trim58Q5NCC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Trim58Q5NCC9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Trim58Q5NCC9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim58Q5NCC9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim58Q5NCC9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim58Q5NCC9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim58Q5NCC9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trim58Q5NCC9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms