Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Trim41Q5NCC3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim41Q5NCC3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms