Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nlrc3Q5DU56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc3Q5DU56 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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