Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf608Q56A10 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf608Q56A10 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms