Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn2bQ56A07 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms