Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdv3Q4VAA2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdv3Q4VAA2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms