Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxn3Q499D0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxn3Q499D0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms