Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srbd1Q497V5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srbd1Q497V5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms