Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt35Q497I4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt35Q497I4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms