Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lin28bQ45KJ6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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