Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ulk4Q3V129 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ulk4Q3V129 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms