Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Capn13Q3UW68 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Capn13Q3UW68 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms