Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clpsl2Q3UW21 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms