Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm5460Q3UQ97 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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