Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skap2Q3UND0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skap2Q3UND0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms