Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lsg1Q3UM18 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms