Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc33Q3ULW6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms