Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ell2Q3UKU1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms