Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp19Q3UJD6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp19Q3UJD6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms