Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cops9Q3U898 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cops9Q3U898 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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