Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Q3U6N9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q3U6N9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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