Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gse1Q3U3C9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms