Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hvcn1Q3U2S8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hvcn1Q3U2S8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms