Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam193bQ3U2K0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms