Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Palb2Q3U0P1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Palb2Q3U0P1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms