Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
1700066B19RikQ3TS39 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms