Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms