Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp39Q3TIX9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp39Q3TIX9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms