Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Colec11Q3SXB8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Colec11Q3SXB8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Colec11Q3SXB8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Colec11Q3SXB8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Colec11Q3SXB8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms