Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbp8Q2V6D6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms