Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Teddm2Q208S0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Teddm2Q208S0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms