Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cers3Q1A3B0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cers3Q1A3B0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms