Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ptchd1Q14B62 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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ptchd1Q14B62 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ptchd1Q14B62 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ptchd1Q14B62 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms