Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd3Q14AI6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rpusd3Q14AI6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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