Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cpne7Q0VE82 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cpne7Q0VE82 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms