Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf541Q0GGX2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms