Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ssrp1Q08943 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ssrp1Q08943 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms