Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ebf1Q07802 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms